En México existen numerosos centros de investigación, esparcidos en diversos puntos de la República que facilitan la labor científica en el país.
Instituto de Astronomía de la Universidad Nacional Autónoma de México (IA-UNAM)
El Instituto de Astronomía de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), tiene bajo su responsabilidad el Observatorio Astronómico Nacional (OAN) de San Pedro Mártir (SPM), en el estado de Baja California; y en Tonanzintla, en el estado de Puebla. La sierra de San Pedro Mártir es uno de los dos mejores sitios en el hemisferio Norte (el otro es Hawai) para realizar observaciones astronómicas, debido a sus óptimas condiciones atmosféricas, que además cuenta con la adecuada infraestructura para un observatorio astronómico de competencia internacional. El Instituto de Astronomía tiene planes de desarrollo para el OAN que lo pueden llevar a convertirse en uno de los observatorios más importantes del mundo. El Instituto de Astronomía también participa en la maestría y doctorado en ciencias (astronomía) que otorga la UNAM.
Ensenada IAUNAM-E, una de las sedes del Instituto de Astronomía de la UNAM, se estableció en 1974 con el propósito de apoyar las actividades del Observatorio Astronómico Nacional de San Pedro Mártir B.C. Desde entonces, la sede se ha venido fortaleciendo académicamente. Sus funciones principales son: el desarrollo de Investigación Astronómica, el desarrollo Tecnológico e Instrumental, la Docencia y la Divulgación Científica.
Instituto de Astronomía CU: http://www.astroscu.unam.mx/ia_cu/home.htm
Instituto de Astronomía Ensenada: http://bufadora.astrosen.unam.mx/indexeda.html
Mapa satelital
OAN Tonantzintla: http://www.astroscu.unam.mx/Tonantzintla/Index.html
OAN San Pedro Mártir: http://www.astrossp.unam.mx/indexspm.html
Instituto Nacional de Astrofísica Óptica y Electrónica (INAOE)
El Instituto Nacional de Astrofísica, Óptica y Electrónica (INAOE) fue creado por decreto presidencial el 11 de noviembre de 1971 como un organismo descentralizado, de interés público, con personalidad jurídica y patrimonio propio, ubicado en Tonantzintla, Puebla.
EL INAOE es heredero de una gran tradición científica que data de 1942, cuando Luis Enrique Erro fundó el Observatorio Astrofísico Nacional de Tonantzintla. En aquel entonces, Tonantzintla se escogió como el lugar idóneo para la instalación del Observatorio, el cual cumplía con las exigentes normas de calidad como noches despejadas y en cantidad por año, así como altura geográfica y mínima incidencia luminosa de poblaciones cercanas, ya que en la capital de la República no era posible instalar un moderno Observatorio.
El INAOE posee una colección de alrededor de 15 mil placas astro-fotográficas obtenidas en la Cámara Schmidt de diversas regiones de la bóveda celeste, principalmente de las constelaciones de Orión, el Toro, Cáncer, Semelor, Escorpio, Sagitario, Osa Mayor, Osa Mayor, entre otras.
Centro de Radioastronomía y Astrofísica UNAM Morelia
El Centro de Radioastronomía y Astrofísica de la UNAM (CRyA) está ubicado en la ciudad de Morelia, Michoacán en el campus de la UNAM que se encuentra en la antigua carretera a Pátzcuaro. El terreno donde se ubica el campus fue donado a la UNAM en 1994 por el Gobierno del Estado de Michoacán
El centro se gestó en 1995 como una subsede del Instituto de Astronomía de la UNAM en la ciudad de Morelia con un pequeño grupo de astrónomos. Actualmente agrupa a 18 jóvenes investigadores que son líderes académicos en varias áreas de la astrofísica y cuyos trabajos han alcanzado reconocimiento internacional.
Área de Astronomía de la Universidad de Sonora
El 15 de febrero de 1990 fue formada el Área de Astronomía en el Centro de Investigación en Física de la Universidad de Sonora con el objetivo de desarrollar investigación y programas de observación en Astronomía, crear infraestructura para los programas de observación, apoyar a la docencia en Astronomía y Astrofísica y poseer programas de divulgación hacia todos los sectores de la comunidad.
El interés principal de investigación del Área se ha dirigido hacia la Física Solar y la Astrofísica Extragaláctica.
Instituto de Astronomía y Meteorología, Universidad de Guadalajara

El Instituto de Astronomía y Meteorología toma este nombre a partir de 1947, su antecedente inmediato, el Observatorio Astronómico, Sismológico y Meteorológico del Estado, pasó a formar parte de la Universidad de Guadalajara el 12 de Octubre de 1925, fecha de inauguración de la Universidad, convirtiéndose así en su primer dependencia dedicada principalmente a la investigación. Las primeras referencias sobre el Observatorio Astronómico y Meteorológico del Estado fijan su fundación el 2 de abril de 1989, por lo que el 2009 representa su 120 aniversario.
Actualmente el grupo de astronomía del Instituto cuenta con 6 investigadores que imparten cursos de astrofísica a nivel licenciatura y de postgrado dentro de los programas de maestría y doctorado en Física de la Universidad de Guadalajara. En el Instituto, situado en Av Vallarta 2602 se ofrecen también talleres y conferencias de divulgación así como diversas actividades de difusión de la ciencia.
Grupo de Astrofísica de la Escuela Superior de Física y Matémáticas del IPN (Astro-ESFM)
En el Instituto Politécnico Nacional se está armando un posgrado de astronomía y un grupo de investigación con un enfoque instrumental/observacional.
Instituto Avanzado de Cosmología del Instito Politecnico Nacional